浙江杭州人。女。1963年毕业于北京大学历史系考古专业。同年9月到敦煌文物研究所工作，1975年任副所长，1984年任敦煌研究院副院长，1988年任副研究员，1994年任研究员。撰有《莫高窟发现的唐代丝织物及其它》、《莫高窟隋代石窟分期》、《莫高窟北周石窟造像与南朝的影响》等；参与多部有关敦煌图书图版说明的撰写。
1938年出生于北平，在上海长大，1963年毕业于北京大学历史系考古专业，毕业后来到敦煌文物研究所，开始了敦煌石窟考古研究的生涯。那时，中国的石窟考古研究刚刚起步，对于刚毕业的她来说，无疑充满了挑战。色彩斑斓的壁画、彩塑，由佛像画、故事画、经变画等组成的恢宏的艺术世界，每天都吸引着她，使她忘却了沙漠中生活的极端艰苦。
樊锦诗于1977年任副所长，1984年8月任敦煌研究院副院长，1998年4月任敦煌研究院院长，2015年1月起任敦煌研究院名誉院长。她带领科研人员，在石窟遗址的科学保护、科学管理上走出了一条切实可行的路，初步形成了一些石窟科学保护的理论与方法。她最早提出利用计算机技术实现敦煌壁画、彩塑艺术永久保存的构想。
